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大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

基礎生物学研究所

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共同利用研究

トレーニングコース - 開催リスト

ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース2022夏 RNA-seq入門

Organizers 重信 秀治、内山 郁夫(基礎生物学研究所)
Venue オンライン
Date Aug. 31-Sep. 1, 2022
Link ウェブサイト (https://www.nibb.ac.jp/gitc/2022-1st/)
バイオインフォマティクスを専門としない生物学研究者を対象に、次世代シーケンシング(NGS)技術を使ったトランスクリプトーム解析(RNA-seq)をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。
本コースは2日間の日程で開催されます。RNA-seq入門では、RNA-seqによる発現変動解析の原理を理解した上で、実践的なデータ解析パイプラインを習得します。


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Program
「RNA-seq入門 : RNA-seq解析パイプライン」 2022年8月31日(水)10:00~ 9月1日(木)18:30
     RNA-seq入門 概論
     NGS基本データフォーマット復習
     NGS基本ツール:Bowtie2、samtools、IGVなど
     RNA-seq基礎・トランスクリプトベース・ゲノムベース・de novo
     多変量解析
     機能アノテーションと GO 解析
     実践演習
     まとめ