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大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

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ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース2024春 RNA-seq入門「RNA-seq入門 - NGSの基礎からde novo解析まで」

Organizers 重信 秀治、内山 郁夫(基礎生物学研究所)
Venue オンサイト(現地)での受講参加とオンラインでの聴講参加のハイブリッド開催
Date Feb. 28-29, 2024
Link ウェブサイト (https://www.nibb.ac.jp/gitc/2023-3rd/)
バイオインフォマティクスを専門としない生物学研究者で、これから次世代シーケンシング(NGS)データの解析を行おうとしている方を対象に、ゲノムインフォマティクスの基礎的技術と考え方を身に着けることを目的としたコースです。
本コースは2日間の日程で開催されます。RNA-seq入門では、RNA-seqによる発現変動解析の原理を理解した上で、実践的なデータ解析パイプラインを習得します。
Program
「RNA-seq入門 : RNA-seq解析パイプライン」 2024年2月28日(水)10:00~ 29日(木)18:30
     RNA-seq入門 概論
     NGS基本データフォーマット復習
     NGS基本ツール:Bowtie2、samtools、IGVなど
     RNA-seq基礎・トランスクリプトベース・ゲノムベース・de novo
     多変量解析
     機能アノテーションと GO 解析
     実践演習
     まとめ