基礎生物学研究所
| Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、三輪 朋樹、山口 勝司、西出 浩世、中村 貴宣（基礎生物学研究所）、佐藤 昌直 （北海道大学大学院） | |
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| Venue | 基礎生物学研究所 | |
| Date | Mar. 9-10, 2017 | |
| Link | ウェブサイト （http://www.nibb.ac.jp/training/2017-1st/） | |
生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シークエンサー(NGS)を使ったトランスクリプトーム解析（RNA-seq）をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。次世代シークエンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から、ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までを2日間でカバーします。講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います。
受講者21名（応募85名）
３月９日（木）
09:30 受付開始
10:00 - 10:45 RNA-seq入門 概論
10:45 - 11:45 NGS基本フォーマットとツール 補足と復習
11:45 - 12:45 (Lunch)
12:45 - 13:30 NGS基本フォーマットとツール 補足と復習
13:30 - 14:30 NGS基本ツール：IGV
14:30 - 15:00 復習タイム （自習）
15:00 - 16:30 統計学入門
16:30 - 16:40 休憩
16:40 - 17:40 RNA-seqの解析パイプライン：基礎
17:40 - 19:00 RNA-seq：ゲノムベース
19:00 - 19:30 復習タイム （自習）
３月10日（金）
09:00 - 10:20 RNA-seq：トランスクリプトベース
10:20 - 10:40 復習タイム （自習）
10:40 - 12:00 多変量解析
12:00 - 13:00 (Lunch)
13:00 - 13:30 復習タイム （自習）
13:30 - 14:30 機能アノテーションとGene Ontology解析
14:30 - 17:00 実践演習
17:00 - 17:30 総括
