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大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

基礎生物学研究所

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共同利用研究

トレーニングコース - 開催リスト

ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース2017春(準備編)UNIX・R・NGSの基本

Organizers 重信 秀治、内山 郁夫、三輪 朋樹、山口 勝司、西出 浩世、中村 貴宣(基礎生物学研究所)、佐藤 昌直 (北海道大学大学院)
Venue 基礎生物学研究所
Date Feb. 23-24, 2017
Link ウェブサイト (http://www.nibb.ac.jp/training/2017-1st/)

 データ解析を行う際の共通の基盤として、Unixオペレーティングシステム、および統計解析パッケージRの基本的な使い方を学習します。UnixやRのコマンドを使った基本的な処理の流れを習得することを目的としますが、演習では次世代シーケンサーのデータ解析を想定した例題も扱います。

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受講者22名(応募85名)

Program

2月23日
09:30-       受付開始
10:00-10:05  挨拶
10:05-10:45  GITC概要
10:45-12:00  UNIX基本コマンド(前編)
12:00-13:00  (昼休憩)
13:00-14:30  UNIX基本コマンド(後編)
14:30-14:45  (休憩)
14:45-15:45  エディタとスクリプト 
15:45-18:30  R入門    
18:45-       懇親会(研究交流室)

2月24日
08:30-09:00  (開場・復習)
09:00-10:10  NGS基本データフォーマットとクオリティコントロール 
10:10-10:25  (休憩)
10:25-12:00  NGS基本ツール 
12:00-13:00  (昼休憩)
13:00-14:00  UNIXによるテキストファイル処理 
14:00-15:00  生物情報解析システムの紹介 
15:00-17:00  演習