基礎生物学研究所
| Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、三輪 朋樹、山口 勝司、西出 浩世、中村 貴宣（基礎生物学研究所）、佐藤 昌直 （北海道大学大学院） | |
|---|---|---|
| Venue | 基礎生物学研究所 | |
| Date | Feb. 23-24, 2017 | |
| Link | ウェブサイト （http://www.nibb.ac.jp/training/2017-1st/） | |
データ解析を行う際の共通の基盤として、Unixオペレーティングシステム、および統計解析パッケージRの基本的な使い方を学習します。UnixやRのコマンドを使った基本的な処理の流れを習得することを目的としますが、演習では次世代シーケンサーのデータ解析を想定した例題も扱います。
受講者22名（応募85名）
2月23日
09:30- 受付開始
10:00-10:05 挨拶
10:05-10:45 GITC概要
10:45-12:00 UNIX基本コマンド（前編）
12:00-13:00 （昼休憩）
13:00-14:30 UNIX基本コマンド（後編）
14:30-14:45 （休憩）
14:45-15:45 エディタとスクリプト
15:45-18:30 R入門
18:45- 懇親会（研究交流室）
2月24日
08:30-09:00 （開場・復習）
09:00-10:10 NGS基本データフォーマットとクオリティコントロール
10:10-10:25 （休憩）
10:25-12:00 NGS基本ツール
12:00-13:00 （昼休憩）
13:00-14:00 UNIXによるテキストファイル処理
14:00-15:00 生物情報解析システムの紹介
15:00-17:00 演習
