基礎生物学研究所
| Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、山口 勝司、西出 浩世 （基礎生物学研究所） 佐藤 昌直（慶應義塾大学） |
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| Venue | 基礎生物学研究所 | |
| Date | Mar. 10-11, 2016 | |
| Link | ウェブサイト （http://www.nibb.ac.jp/training/2016-1st/） | |
生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シーケンシング(NGS)技術を使ったトランスクリプトーム解析（RNA-seq）をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。次世代シーケンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から、ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までを、講義と演習を組み合わせて行います。
受講者21名（応募69名）
実習内容：
| 3月10日（木） | |
| 9:30 - | 受付開始（基礎生物学研究所 明大寺地区 |
| 10:00 - 10:40 | RNA-seq入門 概論 [重信] |
| 10:40 - 11:40 | NGS基本データフォーマット [山口] |
| (Lunch) | |
| 12:40 - 13:40 | NGS基本ツール：マッピングツールBowtie2 [内山] |
| 13:40 - 14:40 | NGS基本ツール：samtools [西出] |
| 14:40 - 15:10 | 復習タイム （自習） |
| 15:10 - 16:10 | NGS基本ツール：IGV [山口] |
| 16:10 - 16:20 | 復習タイム （自習） |
| 16:20 - 17:50 | 統計学入門 [佐藤] |
| 17:50 - 18:50 | RNA-seq基礎 [重信] |
| 3月11日（金） | |
| 9:00 - 10:30 | RNA-seq：ゲノムベース [山口] |
| 10:30 - 10:45 | 復習タイム （自習） |
| 10:45 - 12:00 | RNA-seq：トランスクリプトベース [重信] |
| (Lunch) | |
| 13:00 - 13:30 | 復習タイム （自習） |
| 13:30 - 14:30 | 多変量解析 [佐藤] |
| 14:30 - 15:00 | 復習タイム （自習） |
| 15:00 - 17:30 | 実践演習 まとめ |
