基礎生物学研究所
Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、山口 勝司、西出 浩世 (基礎生物学研究所) 佐藤 昌直(慶應義塾大学) |
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Venue | 基礎生物学研究所 | |
Date | Sep. 9-11, 2015 | |
Link | ウェブサイト (http://www.nibb.ac.jp/training/2015-2nd/) | |
基礎生物学研究所は、2015年9月9日~11日の日程でゲノムインフォマティクス・トレーニングコース「RNA-seq入門-NGSの基礎からde novo解析まで」を開催します。生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シークエンサー(NGS)を使ったトランスクリプトーム解析(RNA-seq)をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。次世代シークエンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から、ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までを3日間でカバーします。講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います。
受講者22名(応募68名)
実習内容:
RNA-seq概論
UNIX基礎 / R入門
NGS基本フォーマットとNGS基本ツール
統計学基礎 /多変量解析
RNA-seq 解析パイプライン
実践演習