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大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

基礎生物学研究所

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共同利用研究

トレーニングコース - 開催リスト

2015秋「RNA-seq入門 - NGSの基礎からde novo解析まで」

Organizers 重信 秀治、内山 郁夫、山口 勝司、西出 浩世 (基礎生物学研究所)
佐藤 昌直(慶應義塾大学)
Venue 基礎生物学研究所
Date Sep. 9-11, 2015
Link ウェブサイト (http://www.nibb.ac.jp/training/2015-2nd/)

基礎生物学研究所は、2015年9月9日~11日の日程でゲノムインフォマティクス・トレーニングコース「RNA-seq入門-NGSの基礎からde novo解析まで」を開催します。生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シークエンサー(NGS)を使ったトランスクリプトーム解析(RNA-seq)をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。次世代シークエンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から、ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までを3日間でカバーします。講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います。

 

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受講者22名(応募68名)

Program

実習内容:
    RNA-seq概論
    UNIX基礎 / R入門
    NGS基本フォーマットとNGS基本ツール
    統計学基礎 /多変量解析
    RNA-seq 解析パイプライン
    実践演習