基礎生物学研究所
| Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、佐藤 昌直、山口 勝司、西出 浩世、前田 太郎 （基礎生物学研究所） | |
|---|---|---|
| Venue | 基礎生物学研究所 | |
| Date | Sep. 17-19, 2014 | |
| Link | ウェブサイト （http://www.nibb.ac.jp/training/2014-2nd/） | |
日程：
Day-1 PM (13:30-18:30)
- 概論 （重信）45min 13:30-14:15
- UNIX基礎 （西出） 2h 14:15-16:15
- NGS基本フォーマット（前田）1h 16:30-17:30
- NGS基本ツール前半（前田）3h 17:30-18:30
Day-2 AM (9:00-12:15)
- NGS基本ツール後半（山口）9:00-10:30
- 統計学入門（佐藤）1.5h 10:45-12:15
Day-2 PM (13:15-19:15)
- RNAseq基礎（重信）1h 13:15-14:15
- RNAseq genome base（山口）1.5h 14:15-15:45
- 実戦演習１ 16:00-17:00 （ここまでの復習）
- 多変量解析（佐藤）17:15-19:15
Day-3 AM (9:00-12:15)
- R入門 （内山）1.5h 9:00-10:30
- RNAseq de novo（重信）1.5h 10:45-12:15
Day-3 PM (13:15-17:00)
- 実戦演習 2 13:15-16:45 3.5h
- まとめ 重信 16:45-17:00 30min
実習内容：
概論
UNIX基礎
R入門
NGS基本フォーマット
NGS基本ツール (bowtie, IGV, samtools)
統計学入門
RNA-seq基礎
RNA-seq genome base
RNA-seq de novo
多変量解析
実践演習
