基礎生物学研究所
| Organizers | 重信 秀治、内山 郁夫、山口 勝司 （基礎生物学研究所・生物機能解析センター） |
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| Venue | 基礎生物学研究所 | |
| Date | Sep. 8-9, 2011 | |
マイクロアレイや次世代シークエンサーの登場により、生物学者が扱うべきデータの量は日々増大しそして複雑化している。ゲノムインフォマティクストレーニ ングコースは、生物情報学を必ずしも専門としない生物研究者が、これらの大規模データから生物学的な情報を抽出するための、基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースである。
このコースには15名が参加した。オーガナイザーの重信准教授のほか、内山助教、山口技術職員が、①次世代シークエンサーのデータ解析概論、②UNIX入門、③次世代シークエンサーの基本 データフォーマット、④次世代シークエンサーの基本ツール、について実演をまじえながら講義を行った。次世代シークエンシングデータ解析には様々なフォーマットやツールが乱立しているが、汎用性と応用性の高いものを吟味して選択した。
1日目の夕方は懇親会を開催し参加者どうしの情報交換の場とした。コース終了後には、フォローアップ用ウェブサイトを開設し、講義資料の PDF、有用ウェブサイトリンク集を掲載し自習の便を図った。本コースは、実験生物学者を対象にしている点と特定のコンピュータプログラムの使い方のハウツーではなく基礎力習得に重きを置く点で他に例がなく、受講生には好評を得ている。
（重信 秀治）
9月8日(木)
9:30 - 受付開始(基礎生物学研究所 明大寺地区)
10:00 - 11:00 次世代シ-クエンサ-のデ-タ
解析概論
11:00 - 12:00 UNIX入門 (前編)
(Lunch:食堂)
13:00 - 15:00 UNIX入門(後編)
15:15 - 16:00 データ解析デモンストレーション
16:15 - 18:00 次世代シークエンサーの基本データフォーマット
18:30 - 懇親会 (基礎生物学研究所 研究交流室)
9月9日(金)
9:00 - 12:00 次世代シークエンサーの基本ツール
(Lunch:食堂)
13:00 - 17:00 実践演習
