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大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

基礎生物学研究所

共同利用研究

トレーニングコース - 開催リスト

2009「マイクロアレイを用いた遺伝子発現解析」

Organizers 講師: 門田 幸二(東京大学) 中井 雄治(東京大学)
所内担当:成瀬 清(基礎生物学研究所)
Venue 基礎生物学研究所
Date Aug. 19-21, 2009 / Sep. 8-10, 2009

コース概要

cDNA、ゲノムデータの充実によってマイクロアレイによる網羅的発現解析が多くの研究現場で用いられつつある。しかしマイクロアレイから得られる大量のデータを正しく解釈することは必ずしも容易ではない。このコースでは生物情報学を必ずしも専門としない生物研究者がマイクロアレイデータを正しい手法で解析し、バイオインフォマティクスを活用することによってそれぞれの研究を発展させるための基礎的技術・考え方を習得することを目的としている。またすでにマイクロアレイによる解析を行っている方々については各自のデータも持ち寄って解析するほか、個別の問題の解決方法についてもアドバイスをおこなう。リクエストが多ければ、マイクロアレイデータを公共遺伝子発現データベースに投稿するやり方に関する講義を行う。午後の実習・演習は内容の進度に応じてフレキシブルに対応する予定である。3日目に時間的余裕があればGene Ontologyを解析するためのフリーソフトのダウンロードやインストール法についても解説する。ノートパソコン等トレーニングコースに必要な機器は基礎生物学研究所の備品を用いるが各自のデータはUSBメモリー等によって各自持参すること。午前中の講義に関しては公開セミナーとして行うので、講義参加の事前登録は不要である。興味のある方はぜひ参加していただきたい。また個別の問題を解決したい参加者の方はあらかじめ、どのようなデータ解析手段を知りたいのかについて、またGene Ontologyに関する演習では扱いたい生物種についてあらかじめご連絡をお願いしたい。

 

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Program

 第1回 コース日程 (8月19日~8月21日) 

 

2009年8月19日(水)

9時30分~          受付開始

10時~12時        「マイクロアレイ」に関する講義

12時~13時         昼休み

13時~18時        「統計解析ソフトR」の使い方を中心とした実習

18時~   交流会

 

2009年8月20日(木)

9時~10時           実習室にて個別対応

10時~12時        「Gene Ontology解析」に関する講義

12時~13時         昼休み

13時~18時        「Gene Ontology解析」に関する演習

 

2009年8月21日(金)

9時~    講師との質疑応答・個別相談

 

 

 第2回 コース日程 (9月8日~9月10日) 

 

2009年9月8日(火)

9時30分~          受付開始

10時~12時        「マイクロアレイ」に関する講義

12時~13時         昼休み

13時~18時        「統計解析ソフトR」の使い方を中心とした実習

18時~   交流会

 

2009年9月9日(水)

9時~10時           実習室にて個別対応

10時~12時        「Gene Ontology解析」に関する講義

12時~13時         昼休み

13時~18時        「Gene Ontology解析」に関する演習

 

2009年9月10日(木)

9時~    講師との質疑応答・個別相談