私たちは，ステート遷移の能力が特に発達しているクラミドモナスを用いて，ステート遷移の実体について詳しく調べています．

光化学系２を励起し過ぎると，光化学IIの集光アンテナは小さくなり，逆に光化学系１の集光アンテナは大きくなります（この状態をステート２と呼びます）．ステート２の光化学Ｉ，光化学系２を丸ごと単離することに成功したことで，分子メカニズムが少しずつ明らかになってきました．

もともと光化学IIには、反応中心には，単量体であるCP26やCP29を介して三量体LHCIIが結合しています（PSII超複合体）．さらに２個以上のPSII超複合体が結合して，PSIIメガ複合体になります．


ステート遷移が起こると，まず，三量体 LHCIIの一部がリン酸化され，PSIIメガ複合体は１つ１つのPSII超複合体に分離します．