進化多様性生物学領域

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多様性生物学研究室

研究教育職員

栂根 一夫

助教 栂根 一夫

研究の概要

イネの内在性トランスポゾンによる遺伝子発現の制御と、トランスポゾン自身の動態とその制御機構について研究している。トランスポゾンの転移は宿主にとって有害なので、通常トランスポゾンの転移は抑制されてる。イネゲノム中の13%を占めるDNAトランスポゾンの中から、自然栽培条件下で転移できる活性型のトランスポゾンを同定した。このトランスポゾンnDart1は遺伝子に挿入し易い性質をもっているので、遺伝子の機能破壊 / 改変した突然変異体を分離する突然変異系統を作出しでいる。その中から、優性変異や興味深い表現型を示す変異体を数多く同定し、遺伝子の機能解析を行っている。また、トランスポゾンの転移活性はDNAのメチル化などのエピジェネティクな制御を受けていることも明らかにし、さらに活性型をトランスに制御して不活性型にする抑制因子が野生イネのゲノム中に存在するこを明らかにしたので、その構造と制御機構の解明に力を注いでいる。
 

共同研究利用の募集

hATファミリーは、植物で発見され動物にまで存在している起源の古いDNAトランスポゾンです。イネ遺伝子の逆遺伝各的解析や活性なイネのDNAトランスポゾンを利用した共同利用研究に応じる事ができます。

研究室関連資料

参考文献

Hayashi-Tsugane, M., Maekawa, M., Tsugane, K. (2015) A gain-of-function Bushy dwarf tiller 1 mutation in rice microRNA gene miR156d caused by insertion of the DNA transposon nDart1. Sci. Rep. 5, 14357; doi: 10.1038/srep14357

Hayashi-Tsugane, M., Takahara, H., Ahmed, N., Himi, E., Takagi, K., Iida, S., Tsugane, K., and Maekawa, M. (2014). A mutable albino allele in rice reveals that formation of thylakoid membranes requires SNOW-WHITE LEAF1 gene. Plant Cell Physiol. 55, 3-15

 

Eun C.-H., Takagi,K., Park, K.I., Maekawa, M, Iida, S. Tsugane, K. (2012). Activation and Epigenetic Regulation of DNA Transposon nDart1 in Rice. Plant Cell Physiol.53, 857-868
 

Hayashi-Tsugane, M., Maekawa, M., Qian, Q., Kobayashi H., Iida, S. and Tsugane, K. (2011). Examination of transpositional activity of nDart1 at different stages of rice development. Genes Genet Syst., 86,215-219
 

Hayashi-Tsugane, M., Maekawa, M., Kobayashi H., Iida, S. and Tsugane, K. (2011). A rice mutant displaying a heterochronically elongated internode carries a 100 kb deletion. J. Genet. Genomics, 38, 123-128
 

Reviews

Saze, H., Tsugane, K., Kanno, T. and Nishimura, T. (2012). DNA methylation in plants: Relationship with small RNAs and histone modifications, and functions in transposon inactivation. Plant Cell Physiol. 53, 766-784
 

Maekawa M, Tsugane K, Iida S (2011). Effective contribution of the nDart transposon-tagging system to rice functional genomics. Adv Genet Res 4, 259-272

連絡先

栂根 一夫 助教 E-mail: tsugane@nibb.ac.jp TEL: 0564-55-7521