| 自然科学研究機構（NINS） |
基礎生物学研究所（NIBB） 基礎生物学研究所 生命熱動態研究室（亀井研究室） 基礎生物学研究所 時空間制御研究室（野中研） 生命創成探究センター 生物画像情報解析グループ 加藤 輝 基礎生物学研究所 生物機能解析センター 生物機能情報分析室 基礎生物学研究所 生物機能解析センター 情報管理解析室（所内のみ） 総合研究大学院大学 生命科学研究科 基礎生物学専攻 生理学研究所（NIPS） 生理学研究所 バイオフォトニクス研究部門（根本研） 生命創成探究センター（ExCELLS） |
| NOUS（自然科学共同利用・共同研究統括システム） |
| 共同利用研究者宿泊施設（ロッジ） |
| 岡崎コンファレンスセンター（OCC） |
| 顕微鏡予約システム（明大寺）【所内のみ】 |
| 顕微鏡予約システム（山手）【所内のみ】 |
| ABiS（先端バイオイメージング支援プラットフォーム） |
| 国立大学法人 総合研究大学院大学 |
