支援に使用している機器一覧

基礎生物学研究所

光学顕微鏡

機器・装置名 メーカー・型式等  /  特徴 キーワード 設置機関名
ライブ観察用正立多光子顕微鏡

オリンパス・FV1200

長期間の観察に適する。1045nm固定ファイバーレーザーで観察可能なほか、コンフォーカル顕微鏡(4波長)としても使用可能。

二光子顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 深部観察 植物観察 動物観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
光シート顕微鏡2号機

共焦点顕微鏡を利用したセット:ezDSLM(自作機)

オリンパス共焦点顕微鏡FV-1000に自作の光学系及びSCMOSカメラを組み合わせたもの。試料を動かさずに超高速で観察できる光シート顕微鏡。実験内容に応じた仕様変更に柔軟に対応できる。

ライトシート顕微鏡 特殊用途顕微鏡 高速観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
光シート顕微鏡 

ツァイス・Lightsheet 7

照射むらを軽減する双方向照射・ピボットスキャン機能を実装。培養しながらのライブ観察、透明化試料の双方に対応。透明化剤としては有機溶媒系も使用可。試料サイズは最大でマウス成体脳程度。

ライトシート顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 深部観察 植物観察 動物観察 高速観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
倒立二光子顕微鏡

ライカ・SP8

1300nmまでの可変パルスレーザーを搭載し、それに応じて光学系を変更。長波長での励起観察を可能としてSHGまで対応した特殊仕様。

二光子顕微鏡 共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 深部観察 植物観察 動物観察 スペクトルイメージング 高速観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
倒立共焦点顕微鏡

ニコン・A1

高速レゾナントスキャン、スペクトロイメージングが可能。

共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 スペクトルイメージング 高速観察 基礎生物学研究所
正立二光子顕微鏡

ライカ・SP8

1300 nmまでの可変パルスレーザーを搭載し、それに応じて光学系を変更済みである。動物観察などに対応するため、明視野のコンデンサ部分を可変に変更。長波長での励起観察を可能としてSHGまで対応した特殊仕様。

二光子顕微鏡 共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 植物観察 動物観察 スペクトルイメージング 3次元再構築 基礎生物学研究所
正立二光子顕微鏡

オリンパス・FV1200MP

1300 nmまでの可変パルスレーザーを搭載した正立二光子顕微鏡。

二光子顕微鏡 共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 植物観察 動物観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
正立共焦点顕微鏡

オリンパス・FV1000

光刺激用と観察用の紫外光レーザーを装備。

共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 光操作 基礎生物学研究所
小型実験動物用マイクロX線CT

リガク・R_mCT2

低線量タイプで、生体(マウス成体サイズまで)の繰り返し観察(経時変化)を行えるマイクロCT。

特殊用途顕微鏡 3次元再構築 基礎生物学研究所
スピニングディスク倒立共焦点顕微鏡

横河・CSUX1

96穴プレートを用いた多点タイムラプスが可能で、イメージスプリット系(W-View)を併用して高速多点タイムラプス蛍光イメージングが可能。カメラはCMOS、EMCCDなど変更可能。

共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 植物観察 動物観察 高速観察 基礎生物学研究所
インキュベーター型共焦点顕微鏡

横河・CV1000

ピンホールサイズを小さくし、1KのEMCCDを搭載した特殊仕様となっている。照射点間のクロストークが少なく、鮮明な画像を取得可能。

共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
インキュベーター型共焦点顕微鏡

アステックCCM-CSU(CO2インキュベーターに、共焦点光路を追加)

長期間安定した組織培養しながら共焦点観察が可能。

共焦点顕微鏡 特殊用途顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 基礎生物学研究所
IR-LEGO顕微鏡

シグマ光機・IR-LEGO1000

赤外光を利用した局所的遺伝子発現を可能とする顕微鏡システム。システムの開発者自身が世界に先駆けて導入したシステム。レーザー照射の形状を自由に設定できるように変更し、他の照射系及び観察系の光路を追加。

光操作 基礎生物学研究所
長作動距離スピニングディスク顕微鏡

横河・CSUX1

動物等大きなサンプルを高解像度でライブ観察可能なスピニングディスク顕微鏡。顕微鏡部分は自作。

共焦点顕微鏡 特殊用途顕微鏡 タイムラプス撮影 動物観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
正立多光子顕微鏡

オリンパス・FVMPE-RS

680〜1300nm波長可変レーザーと1040nm固定レーザーを搭載し、多光子励起の2波長同時励起が可能な二光子イメージング専用機。

二光子顕微鏡 タイムラプス撮影 深部観察 動物観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
ライブ観察用正立多光子顕微鏡

オリンパス・FV1200

長期間の観察に適する。1045nm固定ファイバーレーザーで観察可能なほか、コンフォーカル顕微鏡(3波長)としても使用可能。

二光子顕微鏡 共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 深部観察 植物観察 動物観察 3次元再構築 基礎生物学研究所
マクロ共焦点レーザー顕微鏡

ニコン・AZ-C1

マクロ専用高NA対物レンズにより広視野で高精細な共焦点像を取得可能。

共焦点顕微鏡 特殊用途顕微鏡 植物観察 動物観察 基礎生物学研究所
倒立共焦点顕微鏡

ツァイス・LSM980-Airy Scan2

超解像モードを搭載した共焦点顕微鏡、タイムラプスにおいてもダメージ少なく撮影可能。

超解像顕微鏡 共焦点顕微鏡 タイムラプス撮影 長時間観察 植物観察 動物観察 高速観察 基礎生物学研究所
スライドスキャナ

浜松ホトニクス・NanoZoomer210

染色された組織切片がマウントされたスライドグラスを高解像度のデジタルデータに変換するスキャナ。多くの切片をデジタル化し、データベース構築に使用。

深部観察 3次元再構築 基礎生物学研究所

画像解析

機器・装置名 メーカー・型式等  /  特徴 キーワード 設置機関名
画像処理用メモリ共有型並列計算機

デル・PowerEdge R930, Intel Xeon E7-8890 x4, 3TB RDIMM

物体認識 セグメンテーション 細胞追跡 画像変換 基礎生物学研究所
トレーニング用講義室

基礎生物学研究所
画像解析ワークステーション

Windows10, メモリ128GB, グラフィックボード16GB, Imaris suite, NIS-elements, LAS-X, Fiji (ImageJ), Office

ニコン及びライカの顕微鏡用解析ソフト、汎用画像解析専用ソフトを使う事が可能。

物体認識 セグメンテーション 細胞追跡 機械学習 3D/4D可視化 3D/4D測定 各種定量 画像変換 基礎生物学研究所
画像解析ワークステーション

Windows10, メモリ128GB, グラフィックボード16GB Imaris suite (オプション機能としてFilament tracerとCELLを含む), Huygens, Fiji (ImageJ), Office

ニコン及びライカの顕微鏡用解析ソフト、汎用画像解析専用ソフトを使う事が可能。

物体認識 セグメンテーション 細胞追跡 機械学習 3D/4D可視化 3D/4D測定 各種定量 画像変換 基礎生物学研究所
画像解析ワークステーション

Windows10, メモリ128GB, グラフィックボード16GB Imaris suite (オプション機能としてFilament tracerとCELLを含む), Huygens, Fiji (ImageJ), Office

汎用画像解析ソフトに加え、デコンボリューション処理ソフトを利用可能。

物体認識 セグメンテーション 細胞追跡 機械学習 3D/4D可視化 3D/4D測定 各種定量 画像変換 基礎生物学研究所
画像解析ワークステーション

Windows10, メモリ128GB, グラフィックボード16GB Imaris suite (オプション機能としてFilament tracerとCELLを含む), Huygens, Fiji (ImageJ), Office

汎用画像解析ソフトに加え、デコンボリューション処理ソフトを利用可能。

物体認識 セグメンテーション 細胞追跡 機械学習 3D/4D可視化 3D/4D測定 各種定量 画像変換 基礎生物学研究所

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