論文発表: 筑波大・和田研究室との共著論文が、PLOS ONE に発表されました

Authors: Hiroyuki Koga, Haruka Fujitani, Yoshiaki Morino, Norio
Miyamoto, Jun Tsuchimoto, Tomoko F. Shibata, Masafumi
Nozawa, Shuji Shigenobu, Atsushi Ogura, Kazunori Tachibana,
Masato Kiyomoto, Shonan Amemiya, Hiroshi Wada
Title: Experimental approach reveals the role of alx1 in the evolution
of the echinoderm larval skeleton
Journal: PLOS ONE
DOI: 10.1371/journal.pone.0149067

RNA-seq 解析によりウニ類における骨片形成の進化過程を明らかにしました。
共同利用研究の成果であるとともに、長谷部新学術の成果でもあります。
共著:重信、(柴田、野澤)

URL: http://www.plosone.org/article/metrics/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0149067

論文発表:神戸大・石崎先生らゼニゴケ研究者コミュニティとの RNA-seq の論文が PCP 誌に発表されました

Authors: Asuka HigoMasaki NiwaKatsuyuki T. YamatoLixy YamadaHitoshi SawadaTomoaki SakamotoTetsuya KurataMakoto ShirakawaMotomu EndoShuji ShigenobuKatsushi YamaguchiKimitsune IshizakiRyuichi NishihamaTakayuki Kohchi and Takashi Araki. (2015).
Title: Transcriptional Framework of Male Gametogenesis in the Liverwort Marchantia polymorpha L .
Journal: Plant & Cell Physiology
doi: 10.1093/pcp/pcw005

URL: https://pcp.oxfordjournals.org/content/early/2016/02/07/pcp.pcw005.abstract

論文発表:井口研究室(基生研)とのワニの RNA-seq の論文が BMC Genomics 誌に発表されました

Authors: Ryohei Yatsu; Shinichi Miyagawa; Satomi Kohno; Benjamin B.
Parrott; Katsushi Yamaguchi; Yukiko Ogino; Hitoshi Miyakawa; Russell
H. Lowers; Shuji Shigenobu; Louis J Guillette Jr; Taisen Iguchi
Title: RNA-seq analysis of the gonadal transcriptome during Alligator
mississippiensis temperature-dependent sex determination and
differentiation
Journal: BMC Genomics
DOI: 10.1186/s12864-016-2396-9

URL: http://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-2396-9

生物機能解析センター 所内セミナーを開催しました

2月10日に生物機能解析センターの所内セミナーを開催しました。

プログラムは以下の通りでした。

16:00 – 16:30
内山 郁夫(情報管理解析室・ゲノム情報研究室)
「大規模データを活用した微生物比較ゲノム解析」

16:30 – 16:50
千葉 啓和(ゲノム情報研究室)
「ドメイン単位のオーソログ分類に基づく融合遺伝子の解析」

16:50 – 17:00
重信 秀治(生物機能情報分析室)
「生物機能情報分析室の活動状況」

17:00 – 17:15
山口 勝司(生物機能情報分析室)
「NIBB-RAD-Seq法の開発」

17:15 – 17:30
森 友子(生物機能情報分析室)
「タンパク質・代謝産物の解析とその分析機器」

17:30 – 17:45
小川 浩太(生物機能情報分析室)
「フィロキセラのゲノム解析から紐解くアブラムシの進化」

17:45 – 18:00
重信 秀治(生物機能情報分析室)
「昆虫のソシオゲノミクス」

http://www.nibb.ac.jp/event/cat115/16/01/post_884.html

重信秀治特任准教授が「第3回次世代シークエンサーを用いた研究推進のためのデータ解析ワークショップ」で講演します

重信秀治特任准教授が12月11日につくば国際会議場で開催される
「第3回次世代シークエンサーを用いた研究推進のためのデータ解析ワークショップ」
で昆虫のゲノム研究に関する講演をします。

詳細は以下の URL をご覧ください。
http://meeting.dna.affrc.go.jp/ngs2015/program.html

ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース 2016 春

基礎生物学研究所は、2016年3月10日~11日の日程でゲノムインフォマティクス・トレーニングコース「RNA-seq入門-NGSの基礎からde novo解析まで」を開催します。

詳しくは以下のページをご覧ください。
http://www.nibb.ac.jp/training/2016-1st/

過去の開催報告に関しては以下のページをご覧ください。
ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース 2015 秋 開催報告

「ガリレオ X 」の撮影が行われました

10月30日に「ガリレオ X 」の撮影が行われました。生物機能情報分析室が管理している次世代シークエンサー illumina HiiSeq 2500/1500, MiSeq を使用した業務風景が撮影されました。

11月15日(日)午前11時30分よりBSフジにて放送予定です。番組では次世代シークエンサーのほか、基礎生物学研究所の多くの研究室の様子が放送されます。是非、ご覧ください。

番組タイトル:「生命科学の立役者!? 知られざる“モデル生物”の世界」
参考 URL : http://www.bsfuji.tv/top/pub/galileox.html