はじめに
基礎生物学研究所は、文部科学省のナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)アサガオの分担機関です。当グループでは、中核機関の九州大学と連携して、おもに花色変異系統、各種DNAクローンの収集・保存・提供を行っています。リソースの寄託、分譲の申し込みは、星野までご連絡下さい。なお、リソースの提供は、研究機関に所属する方のみを対象としております。一般の方への提供は代表機関が行っています。
申し込み:hoshino☆nibb.ac.jp(☆を、@に置き換えて下さい)
代表機関:九州大学理学研究院(アサガオホームページ)
NBRP情報公開サイト:アサガオのデータベース
NBRP情報公開サイト:プロジェクト紹介のページ
NBRP成果論文データベース:Research Resource Circulation
変異系統(アサガオ種子)
アサガオの花色変異系統を中心に、約150系統を保存しています。野生型系統や、マルバアサガオ、ソライロアサガオなど、ほかのIpomoea属の系統も提供可能です。多くの系統は、研究者が実際に研究に使用したもので、変異遺伝子の同定も行われています。
ESTクローン
東京古型標準型の花とつぼみに由来する3種のcDNAライブラリー、実生に由来するcDNAライブラリーを用いてEST配列を得ており、およそ60,000のESTクローンを保存しています。花とつぼみの完全長cDNAライブラリーから得られた25,899のEST配列はBJ553078〜BJ578976とHY918676〜HY949055のアクセッション番号で、実生由来の36,336のEST 配列はCJ736987〜CJ773322とHY949056〜HY949060のアクセッション番号で、種皮由来のEST配列はHY917605〜HY918675までのアクセッション番号で、DDBJなどの公的データベースに登録してあります。 また、全ゲノム配列、RNA-seqをde novoアセンブルした配列を含む独自のデータベースを用意しております。
各種DNA配列のデータベース:http://ipomoeanil.nibb.ac.jp/
BACクローン
東京古型標準型から作成した、105,216のBACクローンを保存しています。これは、800 Mbから1,000 Mbとされるアサガオゲノムを、9から11倍カバーするものです。PCRで目的のBAC DNAをスクリーニングするために、3D DNAプールも用意し、提供しています。最低58反応のPCRで、目的のクローンが得られます。また、23,424のBACクローンの両端配列を解読し、GA9330056〜GA974698のアクセッション番号で、DDBJなどの公的データベースに登録してあります。また、上述の各種DNA配列データベースで検索可能です。
発現ベクター
名古屋大学の白武先生から寄託された、花弁特異的発現ベクターを提供しています。詳細はこちらから。
分譲手続き
分譲の申し込みは、まず星野までご連絡下さい。ご相談頂ければ、研究目的にあったリソースを提案します。分譲に際しては、生物遺伝資源提供同意書(MTA)を締結して頂きます。また、分譲にかかる手数料を、ご負担頂きます(実費徴収)。
リソース分譲の流れ
*BRP:バイオリソースペイメント(NPO法人科学教育研究所によるカード決済システム)
実費徴収について
2010年4月より、分譲にかかる消耗品(袋、チューブなど)、人件費(梱包、発送、MTA締結など)や送料の実費を手数料として徴収しております。リソース自体は無料です。料金表にある手数料を、BRP(バイオリソースペイメント)を介したクレジットカード決済(BRPへのカード手数料はユーザー負担、先払い)もしくは、銀行振込(振込手数料はユーザー負担、後払い)で納付してください。
2019年10月より、消費税率の引き上げに伴い実費が改定されています(新旧対応表)。
区 分 |
手数料等(円) |
カード手数料(円) |
合計(円) |
|
種子 | 提供申請一件当たり | 750 | 1,155 | 1,905 |
1系統当たり | 150 | 31 | 181 | |
DNAクローン | 提供申請一件当たり | 1,900 | 1,155 | 3,055 |
1クローン当たり | 500 | 104 | 604 | |
提供経費(10クローン当たり) | 1,400 | 292 | 1,692 | |
スクリーニングキット | 提供申請一件当たり | 1,100 | 1,155 | 2,255 |
1キット当たり | 7,500 | 1,567 | 9,067 | |
輸送資材費 | 封筒(小) 1枚当たり | 100 | 5 | 105 |
封筒(中) 1枚当たり | 100 | 5 | 105 | |
封筒(大) 1枚当たり | 150 | 8 | 158 | |
封筒(特大)1枚当たり | 300 | 16 | 316 | |
輸送経費 | 実費額 |
実費額の5.5% |
*実費額の105.5% |
*端数切捨て
例:クレジット決済で種子10系統をリクエストする場合、提供申請一件当たりの手数料1,905円、1系統当たりの手数料1,810円、輸送資材費(封筒(中))105円の合計3,820円に、輸送経費の実費額x105.5%が加算されます。銀行振込の場合、提供申請一件当たりの手数料750円、1系統当たりの手数料1,500円、輸送資材費(封筒(中))100円の合計2,350円に、輸送経費の実費額が加算されます。
リソースの寄託
アサガオと近縁種の変異系統、各種DNAクローン、形質転換系統を収集しています。変異系統については、とくに花色変異体を収集しています。市販のアサガオからも、新しい突然変異が現れることがあります。また、過去に研究者が研究に使用し、その後、保存されていない系統(古い園芸系統、販売中止となった市販系統など)を探しています。このような系統をお持ちの方は、ぜひ、ご連絡下さい。
探している系統リスト
連絡先(MTA郵送先)
〒444-8585 愛知県岡崎市明大寺町字西郷中38 基礎生物学研究所 星野敦
hoshino☆nibb.ac.jp(☆を、@に置き換えて下さい)
0564-55-7534