-文部科学省科学研究費補助金「特定領域研究」細胞核ダイナミクス　須賀　則之-

FA架橋によるヒストンH3及びH4テール依存的クロモネマファイバー構造の検出

研究代表者

	須賀　則之　(研究代表者) ＜独）理化学研究所　ゲノム科学総合研究センタータンパク質構造・機能研究グループタンパク質構造研究チーム　研究員＞〒230-0045 横浜市鶴見区末広町1-7-22 TEL: 045-503-9111 (内8288) FAX: 045-503-9460 E-mail: suka@gsc.riken.jp URL: ・主な研究内容・研究室メンバー・最近の研究成果・総説・解説等

主な研究内容

クロマチン超分子複合体の解析
　生命現象を担う遺伝子は細胞核内でクロマチンとして存在しており、このクロマチンの解明が転写調節の理解には欠かすことができない。最近の解析により細胞核内でクロマチンはよく知られている30 nm ファイバーではなく、様々な因子と相互作用し、さらに高次のクロマチン超分子複合体である、“クロモネマファイバー”として存在している事が明らかになっている。すなわち、遺伝子の転写調節はクロモネマファイバーを介して行われている。
　我々はクロモネマファイバーを研究対象とする新しい視点に基づいたクロマチン研究により転写制御を理解したいと考えている。そこで、以下の3つの柱に基づいて研究をすすめている。
１）クロモネマファイバーの生化学的な検出法の開発
２）クロモネマファイバーの構成因子または相互作用する因子の検索、
３）ヒストンアセチル化とクロモネマファイバーのダイナミクスの解析

研究室メンバー

最近の研究成果

Sunada, R., Gorzer, I., Oma. Y., Yoshida, T., Suka, N., Wintersberger, U., and Harata, M. The nuclear actin-related protein Act3p/Arp4p is involved in the dynamics of chromatin-modulating complexes. Yeast 22, 753-768, 2005.

Mellone, B. G., Ball, L., Suka, N., Grunstein, M., Partridge, J. F. and Allshire, R. C. Centromere silencing and function in fission yeast is governed by amino terminus of histone H3. Curr. Biol. 13, 1748-1757, 2003.

Kristjuhan, K., Walker, J., Suka, N., Grunstein, M., Roberts, D., Cairns, B. R. and Svejstrup, J. Q. Transcriptional inhibition of genes with severe histone H3 hypoacetylation in the coding region. Mol. Cell 10, 925-933, 2002.

Suka, N., Luo, K. and Grunstein, M. Sir2p and Sas2p opposingly regulate acetylation of yeast histone H4 lysine 16 and spreading of heterochromatin. Nat. Genet. 32, 378-383, 2002.

Robyr, D., Suka, Y, Xenarios, I., Kurdistani S. K., Wang, A., Suka, N. and Grunstein, M. Microarray Deacetylation Maps Determine Genome-Wide Functions for Yeast Histone Deacetylases. Cell 109, 437-446, 2002.

Suka, N., Suka, Y., Carmen, A. A., Wu, J. and Grunstein, M. Highly Specific Antibodies Determine Histone Acetylation Site Usage in Yeast Heterochromatin and Euchromatin. Mol. Cell 8, 473 479, 2001.

Niimi, A., Suka, N., Harata, M., Kikuchi, A. and Mizuno, S. Co-localization of chicken DNA topoisomerase IIa, but not b, with sites of DNA replication and possible involvement of a C-terminal region of through its binding to PCNA. Chromosoma 110, 102-114, 2001.

Wu, J., Carmen, A. A., Kobayashi, R.,Suka, N. and Grunstein, M. HDA2 and HDA3 are related proteins that interact with and are essential for the activity of the yeast histone deacetylase HDA1. Proc Natl Acad Sci U S A. 98, 4391-4396, 2001.

Wu, J., Suka, N., Carlson, M. and Grunstein, M.TUP1 Utilizes Histone H3/H2B Specific HDA1 Deacetylase to Repress Gene Activity in Yeast. Mol. Cell 7, 117-126, 2001.

Volugelauer, M., Wu, J., Suka, N. and Grunstein, M. Global histone acetylation and deacetylation in yeast. Nature 408, 495-498, 2000.

総説・解説等

水野重樹　（編）朝倉書店　2005年7月　分担執筆
細胞核の分子生物学　クロマチン・染色体・核構造-

須賀則之　日本農芸化学会誌 Vol. 78, No. 7, 649-651, 2004, ヒストンH4の16番目のリジンのアセチル化に伴うクロマチン構造変換による転写制御機構

須賀則之　実験医学 Vol. 21 No. 3, 389-391, 2003, H4-K16のアセチル化によるクロマチン境界の維持