基礎生物学研究所
ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース 2022 冬


RNA-seq入門
「RNA-seq入門 - NGSの基礎からde novo解析まで」


オンサイト(現地)での受講参加とオンラインでの聴講参加のハイブリッド開催です
RNA-seq入門 : RNA-seq解析パイプライン
2023年3月1日(水)10:00 ~ 3月2日(木)18:30

バイオインフォマティクスを専門としない生物学研究者を対象に、次世代シーケンシング(NGS)技術を使ったトランスクリプトーム解析(RNA-seq)をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。
本コースは2日間の日程で開催されます。RNA-seq入門では、RNA-seqによる発現変動解析の原理を理解した上で、実践的なデータ解析パイプラインを習得します。

次世代シーケンサーによるトランスクリプトーム実験 (RNA-seq)を行っている、もしくは行おうとしている研究者。本トレーニングコースは、バイオインフォマティクス専門家の養成コースではなく、いわゆる”wet”研究者がどのようにインフォマティクスを自分の研究課題に援用するかを学ぶことを目指しています。本トレーニングコースの受講希望者は、NGS解析入門あるいはGITC準備編を過去に受講したことがあるか、NGS解析入門あるいはGITC準備編修了相当のスキルをすでに習得していることを条件とします。

本トレーニングコースの受講対象者は、大学もしくは学術機関に所属する研究者、職員および学生といたします。

重信 秀治

基礎生物学研究所
超階層生物学センター
教授
【オーガナイザー】

内山 郁夫

基礎生物学研究所
超階層生物学センター
准教授
【オーガナイザー】

佐藤 昌直

北海道大学大学院
農学研究院
准教授

山口 勝司

基礎生物学研究所
超階層生物学センター
主任技術員

西出 浩世

基礎生物学研究所
超階層生物学センター
技術主任

「RNA-seq入門 : RNA-seq解析パイプライン」

2023年3月1日(水)10:00 ~ 2日(木)18:30

RNA-seq入門 概論
NGS基本データフォーマット復習
NGS基本ツール:Bowtie2、samtools、IGVなど
RNA-seq基礎・トランスクリプトベース・ゲノムベース・de novo
多変量解析
機能アノテーションと GO 解析
実践演習
まとめ

オンサイト(現地)での受講参加とオンラインでの聴講参加のハイブリッド開催となります。

現地での参加の場合 : 基礎生物学研究所 明大寺地区(アクセスの詳細はこちらをご覧ください)
オンラインでの聴講参加の場合 : 基礎生物学研究所まで来ていただく必要はございません。

オンサイト(現地参加)では、基礎生物学研究所の会議室内で講義を受講していただきます。
オンサイトでの参加の場合、研究所で用意したパソコンを用いて実習を行うため、パソコンをお持ちいただく必要はありません。
講義内で質問事項があった際はお近くのスタッフが対応いたします。

オンライン(聴講参加)では、現地の受講生が聞いている講義のスライドと講師の音声をWEB会議システムを通じて聴講していただきます。
聴講参加の場合、ご自身のパソコンで実習を行います。
講義配信画面と実習画面を同時に開くため、有線LAN接続環境および複数ディスプレイを用意していただけるとより快適に受講していただけます。
講義内での質問対応については対応いたしかねますが、演習で使用するサイトに受講生から寄せられた質問事項を講義終了後にまとめて公開いたします。

申し込み受付開始 : 2022年12月12日(月)
申し込み〆切 : 2023年1月9日(月・祝)
現地開催の定員 : 16名
オンライン聴講参加の定員 : 100名
受講料:無料

受付開始後に掲載する応募登録フォームよりご応募下さい。
googleformを利用した登録となります(外部のページに移動します)。

応募者多数の場合は選考となります。受講の可否は2023年1月18日頃までにメールにてお知らせします。

自然科学研究機構 基礎生物学研究所
ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース事務局
E-mail : nibb-gitc@nibb.ac.jp
TEL : 0564-55-7626