講師：
   重信 秀治 （基礎生物学研究所 生物機能解析センター 特任准教授） [オーガナイザー]
   内山 郁夫 （基礎生物学研究所 生物機能解析センター 助教）
   佐藤 昌直 （基礎生物学研究所 発生遺伝学研究部門 助教）
   山口 勝司 （基礎生物学研究所 生物機能解析センター 技術職員）
   西出 浩世 （基礎生物学研究所 生物機能解析センター 技術職員）
   前田 太郎 （基礎生物学研究所 生物機能解析センター 研究員）

重信 秀治 特任准教授	内山 郁夫 助教	佐藤 昌直 助教	山口 勝司 技術職員	西出 浩世 技術職員	前田 太郎 研究員

コース概要：
基礎生物学研究所は、2015年2月25日〜27日の日程でゲノムインフォマティクス・トレーニングコース「RNA-seq入門-NGSの基礎からde novo解析まで」を開催します。生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シークエンサー(NGS)を使ったトランスクリプトーム解析（RNA-seq）をどのように実験デザインし、どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか、その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです。次世代シークエンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から、ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までを3日間でカバーします。講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います。

 

日程：
2015年2月25日（水）13:00〜27日（金）17:00　2.5日間


実習内容：
2月25日(水)
13:00 -　受付
13:30 - 18:30
    13:30-14:15 - 概論
    14:15-15:55 - UNIX入門
    16:10-17:10 - NGS基本フォーマット
    17:10-18:10 - NGS基本ツール１，２
    18:10-18:30 - 復習タイム(自習)
18:30 - 懇親会

2月26日(木)
9:00 - 19:30
      9:00-10:30 - NGS基本ツール３（可視化ツール）
    10:40-12:10 - 統計学入門
    （昼食）
    13:10-14:40 - R入門
    14:40-15:20 - 復習タイム
    15:20-16:20 - RNA-seq 基礎
    16:20-17:50 - RNAseq genome base
    18:00-19:30 - RNAseq de novo

2月27日(金)
9:00 - 17:00
      9:00-10:00 - 復習タイム
    10:00-11:40 - 多変量解析
     (昼食)
    12:40-16:30 - 実践演習
    16:30-17:00 - まとめ

場所：
基礎生物学研究所　明大寺地区    （アクセスの詳細はこちらをご覧ください）

 

受講対象者：
次世代シークエンサーによるトランスクリプトーム実験 (RNA-seq)を行っている、もしくは行おうとしている研究者。本コースではイルミナのデータを例に進めますが、コース内容のほとんどは他のシークエンサーにも適応可能です。言い換えれば、プラットフォームによらない「基礎力」を身に付けることを目標にしています。本トレーニングコースは、バイオインフォマティクス専門家の養成コースではなく、いわゆる”wet”研究者がどのようにインフォマティクスを自分の研究課題に援用するかを学ぶことを目指しています。特に前提知識は必要としませんが、多少の予習をお願いします。

 

前回の様子

    

 

受講申し込み：
申し込み〆切：２０１５年１月１０日（土）
募集定員：１６名
受講料：無料（懇親会費4,000円程度を別途集金予定）

申込方法：
実習受講希望者は、下記より応募して下さい。　※申し込みは終了しました
応募登録フォーム
応募者多数の場合は選考となります。受講の可否は１月２３日 頃までにメールにてお知らせします。

 

その他：
使用パソコンについて
今回のコースでは、研究所で用意したパソコンを用いて実習を行います。よって、パソコンの持参は必要ありません。
宿泊について
宿泊は、研究所周辺のホテルをご利用下さい。

 

お問い合わせ：
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物機能情報分析室
E-mail : training15@nibb.ac.jp
TEL : 0564-55-7670