2009,10,21, Wednesday
Rで並列処理 snow Rmpi MPICH PBS
プロセス生成機能がなく、mpirun を使わないといけないMPICHと、
RとsnowとRmpiとPBSとの連携
snowは普通にインストールする。
Rmpi インストール時、RmpiがMPIシステムを探しているのですが、その順番が
OpenMPI → LAM → MPICH or MPICH2
なので、戯れに違うMPIが入ってたりすると何だかわけのわからないことに。
（補足：MPICHを探す場所は、 /usr/lib/mpi or /usr/lib/mpich 他は知らん）
続き▽
RとsnowとRmpiとPBSとの連携
snowは普通にインストールする。
Rmpi インストール時、RmpiがMPIシステムを探しているのですが、その順番が
OpenMPI → LAM → MPICH or MPICH2
なので、戯れに違うMPIが入ってたりすると何だかわけのわからないことに。
（補足：MPICHを探す場所は、 /usr/lib/mpi or /usr/lib/mpich 他は知らん）
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