2009,04,17, Friday
GenSCAN を使う
続きませんでした、スミマセン
コレ
http://genes.mit.edu/GENSCANinfo.html
Sunのバイナリがあったのでダウンロード
% genscan parameter_file_path genome_file_path
Error: calloc failed on CUM_SCORE array
うーん この他にも
Error: calloc failed on POLYA_SCORE array
と出たりもする.....
どうもローカルgenscanは2MB以上のファイルを読めないらしい。
2MBて！
あと、MultiFASTAもダメで、結局 1scaffold/1file に分割。
細かいscaffold だったのでどれも2MB以上にはならず、
無事プログラムは終了しました。
コレ
http://genes.mit.edu/GENSCANinfo.html
Sunのバイナリがあったのでダウンロード
% genscan parameter_file_path genome_file_path
Error: calloc failed on CUM_SCORE array
うーん この他にも
Error: calloc failed on POLYA_SCORE array
と出たりもする.....
どうもローカルgenscanは2MB以上のファイルを読めないらしい。
2MBて！
あと、MultiFASTAもダメで、結局 1scaffold/1file に分割。
細かいscaffold だったのでどれも2MB以上にはならず、
無事プログラムは終了しました。
| BioInformatics::Software | 05:34 PM | comments (0) | trackback (x) |