大学共同利用機関法人 自然科学研究機構

基礎生物学研究所

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共同利用研究

トレーニングコース - 開催リスト

ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース2017夏「大規模な生物データ解析のための UNIX 入門」

Organizers 内山 郁夫、三輪 朋樹、西出 浩世、中村 貴宣(基礎生物学研究所)
Venue 基礎生物学研究所 明大寺地区
Date Jun. 22-23, 2017
Link ウェブサイト (http://www.nibb.ac.jp/training/2017-2nd/)

生物情報学を専門としない生命科学研究者を対象に、次世代シーケンサ(NGS)のデータ解析をはじめとした大規模な生物データの解析を、UNIXオペレーティングシステム上で行うことを目指したコースです。

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受講者22名 (応募45名)

Program

6月22日(木)

12:30-       受付開始

13:00-13:30  挨拶 [内山]

13:30-16:30  UNIX基本コマンド  [三輪]

16:30-17:00  (休憩・復習タイム)

17:00-18:00  エディタとシェルスクリプト  [中村]
 

6月23日(金)

08:30-09:00  (開場・復習タイム)

09:00-10:30  次世代シーケンサ用解析コマンド   [内山]

10:30-11:30  SunGridEngine使用方法  [西出]

11:30-12:00  UNIXによるテキストファイル処理(前編)  [中村]

12:00-13:00  (昼休憩)

13:00-13:30  UNIXによるテキストファイル処理(後編)  [中村]

13:30-15:00  シェルスクリプト2  [西出]

15:00-17:00  実践演習